Grundsätzlich ist das Nummernformat 1250.00 für die Zahl 1.250,00 (nach deutscher Schreibweise) korrekt. Der CSV-Exporter versucht agnostisch zu sein und nimmt deswegen die international weit verbreitete Schreibweise (Punkt als Dezimaltrennzeichen, kein Tausendertrennzeichen). Das machen viele Softwarewerkzeuge, die international arbeiten - so wie auch r3.
Excel kann ohne Kontext nicht wissen, welche Zahlenformatierung gewählt worden ist. Deswegen muss man beim CSV-Import (Excel->Daten aus Text importieren) das korrekte Zahlenformat auswählen; dann wird es von Excel auch korrekt als Zahl interpretiert. Wenn man hingegen ohne Auswahl, oder per Doppelklick auf eine CSV-Datei, in Excel die Datei einliest, wird die deutsche Formattierung angenommen und es werden keine Zahlen erkannt.
Kurz: Bitte die Zahlenformate für die jew. Spalten beim Import in Excel korrekt auswählen. Das funktioniert nicht, wenn man die Datei per Doppelklick in Excel öffnet.
In REI3.12 (aktuell in der Beta) inkludieren wir die Option, beim CSV-Export ein Zahlenformat zu definieren. Das ist zwar weniger kompatibel, wenn man Daten international austauscht; für das direkte Bearbeiten in Excel in der gleichen Sprache hilft es aber.